北京白癜风哪家医院看的好 http://wapyyk.39.net/bj/zhuanke/89ac7.html近年来,多维组学联合分析成为大趋势,经常出现在高分文章中。而“泛癌”pancancer研究尤其火热,泛癌就是在研究当下的癌种后,再扩大范围到其他癌种,可以是所有肿瘤的大泛癌,也可以是诸如呼吸系统、消化系统肿瘤的小泛癌。总之,想要文章有深度,发现某个基因、biomarker,千万别完,继续分析该发现在其他病种中的特征,如果一致就说这个发现具有广泛性,不一致就说不同病种有异质性。
在pubmed中搜一个“pancancer”,就可以发现近年来相关文献发表量在逐年递增。
于是,为了跟上时代的潮流热点,我们新增泛癌分析工具。
比如来一个多个肿瘤组织和正常组A2M基因的表达情况,如下图,与正常组相比一些肿瘤中呈现低表达,一些呈现高表达,由于TCGA数据库中癌旁组织较少,这里我们将GTEx数据库纳入正常组对照。
同样还可以A2M基因表达在不同肿瘤中的预后情况,在这里我们通过森林图对结果进行展示。可以看到在KIRC、LGG、LUAD、STAD中呈现显著差异。
当然除了表达和预后之外还可以分析免疫检查点、免疫评分、TMB和MSI。
还是那句话,图例,方法学展示在图片下方;高清矢量图,原始数据,仍然是一键下载,如果仍然无法下载,可以点击红框按钮,按照提示操作即可。
大家还有其他什么想法,都可以在